กลุ่มนโยบายและแผนลุ่มน้ำ มีอำนาจหน้าที่ ดังนี้

• ศึกษา วิเคราะห์ และวิจัยเกี่ยวกับทรัพยากรน้ำเพื่อใช้ประกอบการพิจารณาจัดทำแผนแม่บท การใช้ การพัฒนา การพื้นฟูและการอนุรักษ์ การบำรุงรักษาทรัพยากรน้ำในเขตลุ่มน้ำ
• ศึกษา วิเคราะห์ เกี่ยวกับความเหมาะสมทางวิศวกรรม ของแผนงานและโครงการเกียวกับทรัพยากรน้ำในเขตลุ่มน้ำ
• ศึกษา วิเคราะห์ กำหนดแนวทาง หลักเกณฑ์และระเบียบ เพื่อจัดทำกรอบแนวทางการจัดลำดับความสำคัญและกลั่นกรองแผนงานและโครงการ รวมทั้งแผนงประมาณในการดำเนินการใดๆเกี่ยวกับทรัพยากรน้ำ ในเขตลุ่มน้ำ
• สนับสนุน เสนอแนะ ประสานและบูรณาการหน่วยงาน ของรัฐ องค์กรปกครองส่วนท้องถิ่น และองค์กผู้ใช้น้ำ เพื่อขันคลื่อนแผนแม่บท และจัดทำและจำแผนปฏิบัติการ
• วิเคราะห์ และกลั่นกรอง แผนงาน และโครงการ เสนอคณะกรรมการลุ่มน้ำ และรวบรวมสรุปความเห็นของคณะกรรมการลุ่มน้ำเสนอต่อ กนช.
• ติดตามและประเมินผล แผนแม่บท แผนปฏิบัติการ แผนงบประมาณ การบริหารทรัพยากรน้ำในเขตลุ่มน้ำ
• ให้คำปรึกษา และจัดทำความเห็น เพื่อการปรับปรุงแผนแม่บทในเขตลุ่มน้ำให้สอดคล้องกับบริบทที่เปลี่ยนแปลง
• ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง หรือที่ได้รับมอบหมาย