ส่วนอำนวยการ มีอำนาจหน้าที่ ดังนี้

• ดำเนินการบริหารจัดการงานสารบรรณของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• บริหารและพัฒนาทรัพยากรบุคคลของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• ดำเนินการเกี่ยวกับการเงิน การบัญชี แผนงานงบประมาณ และการพัสดุของ สำนักงานทรัพยากรน้ำแห่ง ชาติภาค
• จัดทำแผนปฏิบัติราชการประจำปี แผนการใช้จ่ายงบประมาณรายจ่ายประจำปี และติดตามประเมินผลการปฏิบัติงาน การจัดระบบงาน การบริหารจัดการต้นทุนผลผลิต การจัดการความรู้การบริหารความเสี่ยงและการควบคุมภายในของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• ดำเนินการด้านเทคโนโลยีสารสนเทศของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• ดำเนินงานด้านอาคารสถานที่ และยานพาหนะของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• ดำเนินการเกี่ยวกับงานช่วยอำนวยการ งานเลขานุการ งานประสานราชการ และ การประชาสัมพันธ์ของสำนักงานทรัพยากรน้ำแห่งชาติภาค
• ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้อง หรือที่ได้รับมอบหมาย